Для публично доступных вики часто становится важным фактор загруженности процессора и дисковой подсистемы связи с обработкой вики большого количества запросов. Высокая загруженность приводит к медленной обработке отдельных запросов или же полной непригодности к использованию легитимными пользователями. Данная ситуация может быть вызвана следующими факторами: Кто-то (спаммеры, вандалы, ...) пытается разместить спам или мусор на страницах вики. Кто-то, использующий кравлер для зеркалирования сайта без ограничений на количество запросов и трафик, что порождает большое количество бесполезных запросов и большой трафик). Поисковые боты, индексирующие вики.

МойнМойн отслеживает запросы по имени пользователя (в случае, если он аутентифицирован) или IP-адресу (если нет) Если количество запросов превышает некий заданный в конфигурации лимит за заданный в конфигурации период времени, то вики начнёт возвращать вместо результата запроса предупреждение защиты от флуда. При этом настоятельно рекомендуется прекратить порождать новые запросы в течение некоторого времени (например, посвятив его чтению уже полученных страниц). По истечению некоторого времени можно продолжить без каких-либо последствий (пока какой-то из лимитов не будет превышен вновь). В случае продолжения генерации запросов, вики заблокирует пользователя или IP на заданный конфигурации период времени.

Настройка механизма защиты от флуда выполняется посредством указания параметров в конфигурации вики. Ниже представлены значения по умолчанию: запросов, вызывающих <действие> за <период времени> секунд]]>

В случае, если между пользователями находится прокси или маршрутизатор с NAT, отличным от «один к одному» (например, в корпоративной сети или Китае), у пользователей возможны проблемы с защитой от флуда, так как к вики приходят запросы с одного (или некоторого количества фиксированных) IP, что выглядит как действия бота или нерадивого пользователя. Это ограничение можно обойти, аутентифицировавшись в вики, дабы МойнМойн учитывал запросы отдельных пользователей (в случае, если пользователь аутентифицирован, то счётчики работают по имени учётной записи, не по IP) Проблемы отсутствуют также в случае, если прокси добавляет в HTTP-запрос заголовок X-Forwarded-For с реальным IP пользователя.

(!) Отключать защиту от флуда не рекомендуется. Если она активируется слишком часто, возможно, стоит настроить лимиты. Даже в случае локальной вики пользователь, решивший запустить на вики кравлера, может вызвать проблемы и сделать вики непригодной к использованию. Для отключения защиты достаточно сделать следующее: